17 知っておくべきエンドヌクレアーゼ酵素の例 -

エンドヌクレアーゼは壊れる酵素です DNA ポリヌクレオチド鎖内のホスホジエステル結合を切断することにより、より小さな断片にします。その例をいくつか見てみましょう。

RecBCDエンドヌクレアーゼ
T7エンドヌクレアーゼ
T4 エンドヌクレアーゼ II
Bal31エンドヌクレアーゼ
エンドヌクレアーゼ I
小球菌ヌクレアーゼ
エンドヌクレアーゼ II
S1ヌクレアーゼ
P1-ヌクレアーゼ
マングビーンヌクレアーゼI
DNase I 酵素 (P00639)
APエンドヌクレアーゼ
BamHI
EcoRI
EcoRV
HindⅢ
ヘⅢ

RecBCDエンドヌクレアーゼ

RecBCD エンドヌクレアーゼは で生産 E. 大腸菌の セル。 部分的に ATP 依存性であり、組換えと修復で機能します。 RecBCD 酵素は、 ヌクレアーゼとヘリカーゼの二重の役割、 DNA鎖を収縮または分離し、DNAに一本鎖ニックを生成します。

T7エンドヌクレアーゼ（P00641）

ファージ T7 (遺伝子 3) のソースです T7 エンドヌクレアーゼ酵素。 Replication 二本鎖よりも一本鎖の傾向がある DNA を必要とします。に特に結合する酵素 XNUMXウェイ（ホリデー）DNAジャンクションを切断します ジャンクションを解決するためのウイルスゲノム複製に従います。

T4エンドヌクレアーゼII（P07059）

ファージ T4 (denA) のソースです T4 エンドヌクレアーゼ II。 この酵素によって生成される 5'-dCMP 末端オリゴヌクレオチドは、-TpC- 配列から分割されます。商品のチェーンの長さは状況により異なります。の援助 宿主DNAの分解、 宿主からヌクレオチドを除去することにより、ファージ DNA の作成を可能にします。

Bal31エンドヌクレアーゼ

P.エスペジアナ のソースです Bal31エンドヌクレアーゼ . さらに、二本鎖 DNA の 3' および 5' 末端は、このエンドヌクレアーゼによって変更されます。高速酵素と低速酵素の両方を組み合わせた少なくとも XNUMX つのヌクレアーゼ。

エンドヌクレアーゼI（endo I; P25736）

E. 大腸菌の (エンドA) のソースです エンドヌクレアーゼ I. Endo I 変異体は、ペリプラズムにあるにもかかわらず適切に発生し続け、平均鎖長 XNUMX を示します。 tRNA、原因 二本鎖DNA付加体、およびtRNAと複合体を形成するとニックが生成されます。

ミクロコッカスヌクレアーゼ (P00644)

ブドウ球菌 のソースです 小球菌ヌクレアーゼ. 3'-P 末端を作成し、一本鎖 DNA と AT リッチ領域を優先し、カルシウムを必要とし、影響を与えます RNAを. DNA と RNA の両方の 5' ホスホジエステル結合を分解する酵素。

エンドヌクレアーゼII（endo VI、exo III; P09030）

コリ (xthA) エンドヌクレアーゼ II のソースです。切断部位の近くには、 3'–>5' エキソヌクレアーゼ、 3'-P 末端にはホスホモノエステラーゼがあります。のプライマリ RE E. 大腸菌の apurinic-apyrimidic endonuclease です。

S1ヌクレアーゼ (P24021)

アスペルギルス・オリゼ がソースです。 RNAも影響を受けます。一本鎖 DNA と RNA のみを分解します。塩基に対する明らかな好みはありません。エンドヌクレアーゼによる切断の最終産物は、 5'-ホスホモノヌクレオチドおよび5'-ホスホオリゴヌクレオチド。

P1-ヌクレアーゼ（P24289）

ペニシリウム・シトリナム がソースです。 RNAも影響を受けます。一本鎖 DNA および RNA のみを分解します。塩基に対する明らかな好みはない. エンドヌクレアーゼ切断によって生成される最終生成物には、 5'-ホスホモノヌクレオチドおよび5'-ホスホオリゴヌクレオチド。

マングビーンヌクレアーゼI

緑豆もやし がソースです。 RNAも影響を受けます。ただし、二本鎖 DNA、DNA/RNA ハイブリッド、または二本鎖 RNA は酵素によって分解されません。それだけ ヌクレオシド 5'-一リン酸を生成する 一本鎖 DNA または RNA が分解されるとき。

DNase I 酵素 (P00639)

ウシの膵臓 がソースです。製品は平均で XNUMX リンクチェーンを持ち、Mn²⁺ 二本鎖切断につながります。 血清エンドヌクレアーゼ 数多く制作されています外分泌および内分泌器官であり、体液に含まれています。

APエンドヌクレアーゼ

核とミトコンドリア ソースです。これには、DNA 塩基除去修復経路が含まれます。 DNA-BER は、AP エンドヌクレアーゼ酵素 (塩基除去修復経路) を使用します。

バムHI

バムHI、によって生成されるタイプ II 制限エンドヌクレアーゼ バチルスアミロリケファシエンス、短い (6 bp) DNA 配列を検出でき、 目的の位置で正確にカットします。

エコRI

エコRI 制限エンドヌクレアーゼ酵素です それは制限修飾システムの構成要素であり、 DNA二重らせんを分解する 特定の場所で断片化します。

エコRV

エコRV II型制限エンドヌクレアーゼです それは名前で行きますエコ32I. 広く利用されている 制限酵素 分子生物学で。

HindⅢ

ヘモフィルスインフルエンザ II 型部位特異的デオキシリボヌクレアーゼ制限酵素 補因子Mgを加水分解する²⁺ DNA パリンドローム配列 AAGCTT を切断します。

**画像のクレジット： HindIII 制限部位 by ヘリクシッタ (CC BY-SA 4.0)**

ヘ3

ヘIIIはエンドヌクレアーゼです 未知の外部 DNA から生物を保護する. 分子生物学の研究室で利用されています。それはバクテリアで発見されたXNUMX番目のエンドヌクレアーゼでした ヘモフィルスaegyptius.

結論

エンドヌクレアーゼと呼ばれる酵素は、ポリヌクレオチド鎖に見られるホスホジエステル結合を分解します。多くの DNA 切断酵素は非常に特定のヌクレオチド配列で切断しますが、デオキシリボヌクレアーゼ I などの他のものは、DNA を多少ランダムに (配列に関係なく) 切断します。